Eğitimde Kullanılacak Materyaller

• Sunum Slaytları: En güncel yayınlardan yararlanarak hazırlanmış kapsamlı derlemelerden oluşan içerikler.

• Videolar ve Animasyonlar: Dizileme süreçlerini görsel olarak anlatan eğitim videoları ve animasyonlar

• Veri Setleri: Veri analizine yönelik örnek NGS ve long-read veri setleri.

• Biyoinformatik Yazılımlar: Veri analizinde kullanılacak ücretsiz veya açık kaynak yazılımlar.

• DEMO LAB*: 3. Nesil Taşınabilir DNA/RNA Dizileme Laboratuvarı Demo Deneyimi

  *Oxford Nanopore Technologies - MinION Dizileme Cihazı,

  Oxford Nanopore Technologies - MinION FlowCell, Akış Hücresi,

  Bento Lab Pro - Portable PCR Workstation (Library Preperation)

  Qubit 4 - Fluorometer (DNA-RNA-Protein Quantification)

  IKA - lab dancer, Cooler Rack, Magnetic Rack,

  EPI2ME™ Yazılımı

Bu program, katılımcılara DNA dizileme teknolojilerinin temellerini öğretmeyi ve bu teknolojilerin çeşitli uygulamalarını anlamalarını sağlamayı amaçlamaktadır. Eğitimin sonunda katılımcılar, Sanger Dizileme, 2. Nesil Dizileme (eski terminoloji ile; Yeni Nesil Dizileme - NGS) ve 3. Nesil Dizileme yöntemleri hakkında kapsamlı bilgi sahibi olacak ve bu teknolojilerin farklı uygulamalarını değerlendirebilme fırsatı bulacaklardır. Ayrıca DNA/RNA dizileme çalışmalarında teknolojinin geldiği en son nokta olan 3. Nesil Taşınabilir DNA/RNA Dizileme Laboratuvarı’nda örnekten sonuca kadar nükleik asitlerin tüm işlem basamaklarını deneyimleme fırsatı bulacaklardır.

09:00 - 09:15: Giriş – Tanışma

Eğitim programının tanıtımı ve hedeflerin belirlenmesi.

09:15 - 10:30: DNA Analizinin Temel İlkeleri

DNA analizinin temel basamaklarını, neden bu analizlerin önemli olduğunu ve temel analiz tekniklerinin neler olduğunu öğreneceğiz.

Sample Collection & Sample Preperation (Numune Toplama ve Numune Hazırlama), DNA Extraction (DNA Ekstraksiyonu), PCR Amplification (PCR Amplifikasyon), Gel Electrophoresis (Jel Elektroforez), Library Preperation (Kütüphane Hazırlığı), Sequencing (Dizileme), Bioinformatic Analyses (Biyoinformatik Analiz)

10:30 - 10:45 Çay - Kahve Molası

10:45 - 12:00: Sanger Dizileme Teknolojisi

Sanger dizileme (Kapiller Elektroforez) tekniğinin ortaya çıkışı, temel prensipleri, Türkiye’de ve tüm dünyada kullanım alanlarını öğreneceğiz.

- Giriş ve Tarihçe

- Temel Kavramlar

- Temel Prensipler

- İşlem Basamakları

- Örnek Uygulamaların İncelenmesi (Genetik Hastalıkların Tanısı, Adli Bilimlerde Kullanımı ve Genom Projeleri)

- Avantajları ve Dezavantajları

12:00 - 13:00: Öğle Yemeği Arası

13:00 - 14:00: 2. Nesil Dizileme (Next Generation Sequencing - NGS) Teknolojileri ve Temelleri

2. Nesil Dizileme Teknolojilerinin (eski terminoloji ile Yeni Nesil Dizileme) temel çalışma prensiplerini, farklılıklarını, Türkiye’de ve tüm dünyada kullanım alanlarını ele alacağız.

- Giriş ve Ön Bilgiler

- 2. Nesil Dizileme Platformları (NGS) ve Teknolojileri ( Illumina, Ion Torrent )

- Temel Prensipleri

- İşlem Basamakları

- Örnek Uygulamaların İncelenmesi (Genetik Hastalıkların Tanısı, Genomik Araştırmalar ve Genom Projeleri)

- Avantajlar ve Dezavantajlar

- Gelecek Perspektifleri

14:00 - 15:00: 3. Nesil DNA/RNA Dizileme Teknolojileri ve Temelleri

3. Nesil DNA/RNA dizileme (Long-read Sequencing) teknolojilerini temel çalışma prensiplerini, farklılıklarını, Türkiye’de ve tüm dünyada kullanım alanlarını ele alacağız.

- Giriş ve Ön Bilgiler

- 3. Nesil Dizileme Nedir?

- Teknolojinin Temel Prensipleri

- 3. Nesil Dizileme Platformları (PacBio , Oxford Nanopore Technologies)

- İşlem Basamakları

- Avantajları ve Dezavantajları

- Örnek Uygulamaların İncelenmesi (Case Studies)

- Gelecek Perspektifleri

15:00 - 15:15: Çay - Kahve Molası

15:15 - 16:00: Veri Analizi ve Biyoinformatik Araçlar

• Veri İşleme ve Kalite Kontrol: Ham verilerin işlenmesi sırasında kalite kontrol aşamaları nelerdir?

• Hizalama ve Montaj (Alignment and Assembly): NGS ve long-read verilerinin hizalanması ve montajı nedir?

• Biyoinformatik Araçlar ve Yazılımlar: Veri analizlerinde kullanılan temel yaygın yazılımlar ve araçlar nelerdir?

16:00 - 16:45: DNA Dizileme Teknolojilerinin Karşılaştırılması

• Sanger vs. NGS vs. Long-Read: Her bir teknolojinin avantajları ve dezavantajları.

• Kullanım Alanları: Genomik araştırmalar, tıbbi genetik, mikrobiyom analizi ve transkriptomik.

• Gelecek Perspektifleri: Yeni gelişmeler ve kişiselleştirilmiş tıp uygulamaları.

16:45 - 17:15: Uygulama : DNA/RNA Dizileme Lab. - DEMO Deneyimi (Portable Sequencing Lab.)

• 3. Nesil Taşınabilir DNA/RNA Dizileme Laboratuvarını birlikte keşfedeceğiz.

• En güncel inovatif teknolojilerle oluşturulmuş 3. Nesil Taşınabilir DNA/RNA Dizileme Laboratuvarı nda; örnekten sonuca kadar nükleik asitlerin adım adım dizileme protokolündeki iş akışları içerisindeki tüm yolculuğuna tanık olacağız.

Sample Collection & Sample Preperation (Örnek Toplama ve Örnek Hazırlama), DNA Extraction (DNA Ekstraksiyonu), PCR Amplification (PCR Amplifikasyon), Gel Electrophoresis (Jel Elektroforez), Library Preperation (Kütüphane Hazırlığı), Sequencing (Dizileme), Bioinformatic Analyses (Biyoinformatik Analiz)

17:15 - 17:30: Kapanış ve Değerlendirme

• Eğitimin Genel Değerlendirilmesi

• Katılım Sertifikalarının Takdimi ve Kapanış.

Aşağıda DNA Analizlerine Giriş Eğitimi (DNA101) programımızın gerçekleştirileceği farklı tarihleri görebilirsiniz. Size en uygun tarihler için kaydınızı tamamlayabilirsiniz.

DNA Analizlerine Giriş Eğitimi (DNA101) Tarihleri:

Eğitim Tarihleri:

Yakında duyurulacaktır.

Eğitim Yeri: Samsun Teknopark

Kontenjan: Sınırlı Kontenjan

Eğitim Ücreti: 2.250 TL + %10 KDV (2.475 TL KDV Dahil)

Eğitim sonunda katılımcılara OMÜ TTO & NARDO Biyoteknoloji - DNA Academy imzalı katılım sertifikası verilecektir.

Ad - Soyad, Fakülte, Bölüm, Lisans/Lisansüstü bilgileriniz ile aşağıdaki mail adresi üzerinden kayıt olabilir, daha detaylı bilgi alabilir ve sorularınızı iletebilirsiniz.

Bilgi ve Kayıt için İletişim: dna-academy@nardobiotech.com